Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1DQ01668 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1DQ01668 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms