Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DEFA6Q01524 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEFA6Q01524 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms