Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK17Q00537 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK17Q00537 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK17Q00537 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms