Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HTRA4P83105 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTRA4P83105 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTRA4P83105 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms