Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRPFP62306 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNRPFP62306 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms