Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNAP25P60880 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAP25P60880 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAP25P60880 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNAP25P60880 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms