Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DEFA1P59665 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEFA1P59665 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEFA1P59665 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms