Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP11P59045 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP11P59045 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP11P59045 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP11P59045 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP11P59045 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP11P59045 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP11P59045 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP11P59045 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP11P59045 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP11P59045 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP11P59045 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP11P59045 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP11P59045 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP11P59045 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP11P59045 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP11P59045 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP11P59045 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP11P59045 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP11P59045 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP11P59045 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP11P59045 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP11P59045 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP11P59045 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP11P59045 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP11P59045 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP11P59045 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP11P59045 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP11P59045 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP11P59045 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP11P59045 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NLRP11P59045 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP11P59045 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms