Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM11AP58511 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM11AP58511 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM11AP58511 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms