Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXL3P58215 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXL3P58215 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms