Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXW4P57775 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXW4P57775 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXW4P57775 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms