Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH12P55289 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH12P55289 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH12P55289 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH12P55289 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH12P55289 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH12P55289 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH12P55289 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH12P55289 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH12P55289 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH12P55289 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH12P55289 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH12P55289 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH12P55289 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH12P55289 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH12P55289 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH12P55289 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH12P55289 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH12P55289 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH12P55289 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH12P55289 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH12P55289 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH12P55289 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH12P55289 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH12P55289 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH12P55289 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH12P55289 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH12P55289 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH12P55289 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH12P55289 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH12P55289 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH12P55289 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH12P55289 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH12P55289 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH12P55289 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH12P55289 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH12P55289 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH12P55289 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH12P55289 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH12P55289 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH12P55289 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH12P55289 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH12P55289 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH12P55289 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH12P55289 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH12P55289 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH12P55289 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH12P55289 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH12P55289 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH12P55289 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH12P55289 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH12P55289 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH12P55289 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH12P55289 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH12P55289 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH12P55289 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH12P55289 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH12P55289 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH12P55289 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH12P55289 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH12P55289 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH12P55289 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH12P55289 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH12P55289 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH12P55289 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH12P55289 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH12P55289 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH12P55289 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH12P55289 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH12P55289 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH12P55289 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH12P55289 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH12P55289 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH12P55289 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH12P55289 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH12P55289 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH12P55289 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH12P55289 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH12P55289 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH12P55289 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH12P55289 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH12P55289 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH12P55289 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH12P55289 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH12P55289 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH12P55289 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH12P55289 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH12P55289 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH12P55289 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH12P55289 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH12P55289 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH12P55289 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH12P55289 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH12P55289 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH12P55289 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH12P55289 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH12P55289 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH12P55289 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH12P55289 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH12P55289 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms