Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CLTCL1P53675 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLTCL1P53675 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLTCL1P53675 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLTCL1P53675 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms