Protein–RNA interactions for Protein: P53040

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, yeastyeast

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF6P53040 ERS1YCR075C 783 nt7.17□□□□□ -1.26
TAF6P53040 MIX17YMR002W 471 nt7.17□□□□□ -1.26
TAF6P53040 SDH8YBR269C 417 nt7.16□□□□□ -1.26
TAF6P53040 CRN1YLR429W 1956 nt7.16□□□□□ -1.26
TAF6P53040 CEM1YER061C 1329 nt7.16□□□□□ -1.26
TAF6P53040 YJL045WYJL045W 1905 nt7.15□□□□□ -1.26
TAF6P53040 SSC1YJR045C 1965 nt7.15□□□□□ -1.26
TAF6P53040 PIL1YGR086C 1020 nt7.15□□□□□ -1.26
TAF6P53040 THR1YHR025W 1074 nt7.15□□□□□ -1.26
TAF6P53040 MEU1YLR017W 1014 nt7.15□□□□□ -1.26
TAF6P53040 ADH6YMR318C 1083 nt7.15□□□□□ -1.26
TAF6P53040 DLD1YDL174C 1764 nt7.15□□□□□ -1.27
TAF6P53040 TAH11YJR046W 1815 nt7.14□□□□□ -1.27
TAF6P53040 PAU21YOR394W 495 nt7.14□□□□□ -1.27
TAF6P53040 PAU22YPL282C 495 nt7.14□□□□□ -1.27
TAF6P53040 ICL2YPR006C 1728 nt7.14□□□□□ -1.27
TAF6P53040 YBR241CYBR241C 1467 nt7.14□□□□□ -1.27
TAF6P53040 CTA1YDR256C 1548 nt7.13□□□□□ -1.27
TAF6P53040 MRP1YDR347W 966 nt7.13□□□□□ -1.27
TAF6P53040 MRPL28YDR462W 444 nt7.13□□□□□ -1.27
TAF6P53040 NMA2YGR010W 1188 nt7.13□□□□□ -1.27
TAF6P53040 RPL2BYIL018W 765 nt7.13□□□□□ -1.27
TAF6P53040 CIT2YCR005C 1383 nt7.12□□□□□ -1.27
TAF6P53040 GSH1YJL101C 2037 nt7.12□□□□□ -1.27
TAF6P53040 NCA3YJL116C 1014 nt7.12□□□□□ -1.27
TAF6P53040 YGL081WYGL081W 963 nt7.11□□□□□ -1.27
TAF6P53040 ADE1YAR015W 921 nt7.11□□□□□ -1.27
TAF6P53040 DPM1YPR183W 804 nt7.11□□□□□ -1.27
TAF6P53040 HBN1YCL026C-B 582 nt7.11□□□□□ -1.27
TAF6P53040 EDC3YEL015W 1656 nt7.11□□□□□ -1.27
TAF6P53040 CCT3YJL014W 1605 nt7.11□□□□□ -1.27
TAF6P53040 DMC1YER179W 1005 nt7.1□□□□□ -1.27
TAF6P53040 BUD20YLR074C 501 nt7.1□□□□□ -1.27
TAF6P53040 RRN10YBL025W 438 nt7.1□□□□□ -1.27
TAF6P53040 MSI1YBR195C 1269 nt7.1□□□□□ -1.27
TAF6P53040 GPH1YPR160W 2709 nt7.1□□□□□ -1.27
TAF6P53040 MSG5YNL053W 1470 nt7.1□□□□□ -1.27
TAF6P53040 HPT1YDR399W 666 nt7.09□□□□□ -1.27
TAF6P53040 PAM17YKR065C 594 nt7.09□□□□□ -1.27
TAF6P53040 YOR343CYOR343C 327 nt7.09□□□□□ -1.27
TAF6P53040 YDR476CYDR476C 675 nt7.08□□□□□ -1.28
TAF6P53040 SMK1YPR054W 1167 nt7.08□□□□□ -1.28
TAF6P53040 YLL066CYLL066C 3618 nt7.07□□□□□ -1.28
TAF6P53040 YCR049CYCR049C 447 nt7.07□□□□□ -1.28
TAF6P53040 YAL045CYAL045C 309 nt7.07□□□□□ -1.28
TAF6P53040 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.07□□□□□ -1.28
TAF6P53040 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.07□□□□□ -1.28
TAF6P53040 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.07□□□□□ -1.28
TAF6P53040 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.07□□□□□ -1.28
TAF6P53040 YOL099CYOL099C 492 nt7.06□□□□□ -1.28
TAF6P53040 TUF1YOR187W 1314 nt7.05□□□□□ -1.28
TAF6P53040 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.05□□□□□ -1.28
TAF6P53040 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.05□□□□□ -1.28
TAF6P53040 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.05□□□□□ -1.28
TAF6P53040 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.05□□□□□ -1.28
TAF6P53040 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.05□□□□□ -1.28
TAF6P53040 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.05□□□□□ -1.28
TAF6P53040 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.05□□□□□ -1.28
TAF6P53040 COX16YJL003W 357 nt7.05□□□□□ -1.28
TAF6P53040 OPI11YPR044C 354 nt7.05□□□□□ -1.28
TAF6P53040 YML122CYML122C 381 nt7.04□□□□□ -1.28
TAF6P53040 TOS1YBR162C 1368 nt7.04□□□□□ -1.28
TAF6P53040 GUT1YHL032C 2130 nt7.03□□□□□ -1.28
TAF6P53040 RTC4YNL254C 1206 nt7.03□□□□□ -1.28
TAF6P53040 YNR014WYNR014W 639 nt7.03□□□□□ -1.28
TAF6P53040 CMK2YOL016C 1344 nt7.01□□□□□ -1.29
TAF6P53040 PAC2YER007W 1557 nt7.01□□□□□ -1.29
TAF6P53040 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.01□□□□□ -1.29
TAF6P53040 HOG1YLR113W 1308 nt7.01□□□□□ -1.29
TAF6P53040 ECM27YJR106W 2178 nt7.01□□□□□ -1.29
TAF6P53040 DOC1YGL240W 753 nt7□□□□□ -1.29
TAF6P53040 RGD2YFL047W 2145 nt7□□□□□ -1.29
TAF6P53040 PPH22YDL188C 1134 nt6.99□□□□□ -1.29
TAF6P53040 YPL247CYPL247C 1572 nt6.99□□□□□ -1.29
TAF6P53040 MPE1YKL059C 1326 nt6.99□□□□□ -1.29
TAF6P53040 ACO1YLR304C 2337 nt6.98□□□□□ -1.29
TAF6P53040 OPI8YKR035C 642 nt6.98□□□□□ -1.29
TAF6P53040 SLA2YNL243W 2907 nt6.98□□□□□ -1.29
TAF6P53040 NFS1YCL017C 1494 nt6.98□□□□□ -1.29
TAF6P53040 ECM38YLR299W 1983 nt6.97□□□□□ -1.29
TAF6P53040 YPQ2YDR352W 954 nt6.97□□□□□ -1.29
TAF6P53040 HSP12YFL014W 330 nt6.97□□□□□ -1.29
TAF6P53040 RPL5YPL131W 894 nt6.97□□□□□ -1.29
TAF6P53040 BDF2YDL070W 1917 nt6.97□□□□□ -1.29
TAF6P53040 AGP2YBR132C 1791 nt6.97□□□□□ -1.29
TAF6P53040 CTF8YHR191C 402 nt6.96□□□□□ -1.3
TAF6P53040 SUR7YML052W 909 nt6.96□□□□□ -1.3
TAF6P53040 TUB1YML085C 1344 nt6.96□□□□□ -1.3
TAF6P53040 YHR131CYHR131C 2553 nt6.96□□□□□ -1.3
TAF6P53040 ARP3YJR065C 1350 nt6.95□□□□□ -1.3
TAF6P53040 URH1YDR400W 1023 nt6.94□□□□□ -1.3
TAF6P53040 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.94□□□□□ -1.3
TAF6P53040 FUS3YBL016W 1062 nt6.94□□□□□ -1.3
TAF6P53040 VTS1YOR359W 1572 nt6.94□□□□□ -1.3
TAF6P53040 PET494YNR045W 1470 nt6.93□□□□□ -1.3
TAF6P53040 TRS31YDR472W 852 nt6.93□□□□□ -1.3
TAF6P53040 DYS1YHR068W 1164 nt6.93□□□□□ -1.3
TAF6P53040 KAE1YKR038C 1161 nt6.93□□□□□ -1.3
TAF6P53040 PEX31YGR004W 1389 nt6.93□□□□□ -1.3
TAF6P53040 PLB2YMR006C 2121 nt6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms