Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPL12P52815 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPL12P52815 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPL12P52815 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPL12P52815 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPL12P52815 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPL12P52815 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MRPL12P52815 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MRPL12P52815 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MRPL12P52815 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRPL12P52815 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRPL12P52815 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRPL12P52815 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRPL12P52815 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRPL12P52815 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRPL12P52815 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms