Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK3P51956 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK3P51956 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK3P51956 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK3P51956 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK3P51956 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK3P51956 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK3P51956 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK3P51956 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK3P51956 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK3P51956 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEK3P51956 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK3P51956 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK3P51956 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK3P51956 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK3P51956 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK3P51956 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK3P51956 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK3P51956 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK3P51956 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK3P51956 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK3P51956 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK3P51956 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK3P51956 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK3P51956 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK3P51956 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK3P51956 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK3P51956 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK3P51956 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK3P51956 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK3P51956 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK3P51956 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK3P51956 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK3P51956 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK3P51956 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK3P51956 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK3P51956 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK3P51956 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK3P51956 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK3P51956 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK3P51956 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK3P51956 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK3P51956 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK3P51956 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK3P51956 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEK3P51956 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK3P51956 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK3P51956 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK3P51956 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK3P51956 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK3P51956 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK3P51956 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK3P51956 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK3P51956 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK3P51956 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK3P51956 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK3P51956 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK3P51956 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK3P51956 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK3P51956 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK3P51956 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK3P51956 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK3P51956 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK3P51956 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK3P51956 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK3P51956 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK3P51956 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK3P51956 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK3P51956 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK3P51956 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK3P51956 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK3P51956 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK3P51956 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK3P51956 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK3P51956 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK3P51956 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK3P51956 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK3P51956 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK3P51956 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK3P51956 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK3P51956 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK3P51956 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK3P51956 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK3P51956 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK3P51956 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK3P51956 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK3P51956 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK3P51956 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK3P51956 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK3P51956 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK3P51956 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK3P51956 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK3P51956 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK3P51956 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK3P51956 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK3P51956 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK3P51956 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK3P51956 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK3P51956 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK3P51956 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms