Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
NUP153P49790 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NUP153P49790 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NUP153P49790 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
NUP153P49790 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
NUP153P49790 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
NUP153P49790 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
NUP153P49790 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
NUP153P49790 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
NUP153P49790 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NUP153P49790 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
NUP153P49790 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NUP153P49790 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NUP153P49790 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NUP153P49790 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
NUP153P49790 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
NUP153P49790 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
NUP153P49790 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
NUP153P49790 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NUP153P49790 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NUP153P49790 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NUP153P49790 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NUP153P49790 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NUP153P49790 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NUP153P49790 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NUP153P49790 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NUP153P49790 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NUP153P49790 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NUP153P49790 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
NUP153P49790 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
NUP153P49790 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NUP153P49790 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
NUP153P49790 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NUP153P49790 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NUP153P49790 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NUP153P49790 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
NUP153P49790 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
NUP153P49790 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NUP153P49790 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NUP153P49790 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
NUP153P49790 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
NUP153P49790 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
NUP153P49790 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
NUP153P49790 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NUP153P49790 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NUP153P49790 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NUP153P49790 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
NUP153P49790 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
NUP153P49790 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NUP153P49790 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NUP153P49790 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NUP153P49790 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NUP153P49790 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NUP153P49790 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NUP153P49790 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NUP153P49790 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NUP153P49790 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NUP153P49790 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
NUP153P49790 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.41■■■■□ 3.9
NUP153P49790 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NUP153P49790 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NUP153P49790 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NUP153P49790 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NUP153P49790 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NUP153P49790 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
NUP153P49790 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
NUP153P49790 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
NUP153P49790 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NUP153P49790 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NUP153P49790 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
NUP153P49790 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NUP153P49790 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
NUP153P49790 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
NUP153P49790 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
NUP153P49790 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NUP153P49790 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NUP153P49790 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NUP153P49790 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
NUP153P49790 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
NUP153P49790 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NUP153P49790 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.32■■■■□ 3.89
NUP153P49790 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
NUP153P49790 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
NUP153P49790 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
NUP153P49790 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NUP153P49790 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NUP153P49790 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NUP153P49790 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NUP153P49790 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NUP153P49790 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NUP153P49790 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NUP153P49790 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NUP153P49790 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
NUP153P49790 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NUP153P49790 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
NUP153P49790 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NUP153P49790 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NUP153P49790 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
NUP153P49790 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NUP153P49790 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms