Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNTBP49356 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNTBP49356 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNTBP49356 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNTBP49356 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNTBP49356 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNTBP49356 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FNTBP49356 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNTBP49356 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNTBP49356 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNTBP49356 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNTBP49356 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNTBP49356 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FNTBP49356 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNTBP49356 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FNTBP49356 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNTBP49356 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNTBP49356 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNTBP49356 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNTBP49356 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTBP49356 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTBP49356 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTBP49356 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTBP49356 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTBP49356 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTBP49356 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTBP49356 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTBP49356 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNTBP49356 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNTBP49356 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNTBP49356 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FNTBP49356 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FNTBP49356 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNTBP49356 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNTBP49356 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNTBP49356 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNTBP49356 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNTBP49356 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNTBP49356 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNTBP49356 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNTBP49356 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNTBP49356 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FNTBP49356 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNTBP49356 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNTBP49356 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNTBP49356 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTBP49356 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTBP49356 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTBP49356 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTBP49356 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTBP49356 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTBP49356 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTBP49356 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTBP49356 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTBP49356 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNTBP49356 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FNTBP49356 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNTBP49356 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNTBP49356 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNTBP49356 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNTBP49356 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNTBP49356 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNTBP49356 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNTBP49356 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNTBP49356 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNTBP49356 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNTBP49356 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FNTBP49356 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNTBP49356 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNTBP49356 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNTBP49356 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNTBP49356 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNTBP49356 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNTBP49356 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNTBP49356 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNTBP49356 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FNTBP49356 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FNTBP49356 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNTBP49356 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNTBP49356 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNTBP49356 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNTBP49356 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNTBP49356 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNTBP49356 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNTBP49356 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNTBP49356 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FNTBP49356 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNTBP49356 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTBP49356 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTBP49356 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTBP49356 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTBP49356 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTBP49356 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FNTBP49356 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FNTBP49356 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTBP49356 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTBP49356 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTBP49356 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNTBP49356 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNTBP49356 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms