Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC1A6P48664 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A6P48664 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A6P48664 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms