Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PIP4K2AP48426 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PIP4K2AP48426 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PIP4K2AP48426 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms