Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF5P43026 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF5P43026 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF5P43026 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF5P43026 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF5P43026 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF5P43026 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF5P43026 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF5P43026 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF5P43026 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF5P43026 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF5P43026 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF5P43026 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF5P43026 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF5P43026 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF5P43026 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF5P43026 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF5P43026 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF5P43026 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF5P43026 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF5P43026 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF5P43026 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF5P43026 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF5P43026 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF5P43026 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF5P43026 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF5P43026 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF5P43026 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF5P43026 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF5P43026 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF5P43026 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF5P43026 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF5P43026 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF5P43026 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF5P43026 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF5P43026 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF5P43026 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF5P43026 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF5P43026 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF5P43026 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF5P43026 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF5P43026 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF5P43026 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF5P43026 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF5P43026 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF5P43026 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF5P43026 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF5P43026 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF5P43026 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF5P43026 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF5P43026 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF5P43026 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF5P43026 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF5P43026 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF5P43026 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF5P43026 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF5P43026 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF5P43026 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF5P43026 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF5P43026 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF5P43026 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF5P43026 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF5P43026 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF5P43026 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF5P43026 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF5P43026 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF5P43026 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF5P43026 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF5P43026 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF5P43026 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF5P43026 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF5P43026 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF5P43026 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF5P43026 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF5P43026 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF5P43026 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF5P43026 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF5P43026 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF5P43026 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF5P43026 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF5P43026 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF5P43026 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF5P43026 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF5P43026 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF5P43026 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF5P43026 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF5P43026 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF5P43026 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF5P43026 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF5P43026 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF5P43026 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF5P43026 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF5P43026 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF5P43026 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF5P43026 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF5P43026 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF5P43026 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF5P43026 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF5P43026 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF5P43026 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms