Protein–RNA interactions for Protein: P42127

ASIP, Agouti-signaling protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIPP42127 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASIPP42127 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASIPP42127 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASIPP42127 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASIPP42127 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASIPP42127 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASIPP42127 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASIPP42127 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASIPP42127 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASIPP42127 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ASIPP42127 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASIPP42127 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASIPP42127 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASIPP42127 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASIPP42127 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASIPP42127 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ASIPP42127 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASIPP42127 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASIPP42127 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASIPP42127 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASIPP42127 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASIPP42127 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASIPP42127 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASIPP42127 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ASIPP42127 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASIPP42127 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASIPP42127 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASIPP42127 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASIPP42127 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASIPP42127 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASIPP42127 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASIPP42127 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASIPP42127 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASIPP42127 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASIPP42127 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASIPP42127 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASIPP42127 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASIPP42127 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASIPP42127 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASIPP42127 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASIPP42127 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASIPP42127 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASIPP42127 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASIPP42127 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASIPP42127 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASIPP42127 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASIPP42127 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASIPP42127 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASIPP42127 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASIPP42127 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIPP42127 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIPP42127 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIPP42127 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIPP42127 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIPP42127 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIPP42127 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIPP42127 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIPP42127 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIPP42127 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIPP42127 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIPP42127 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIPP42127 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIPP42127 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIPP42127 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIPP42127 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIPP42127 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIPP42127 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIPP42127 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIPP42127 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASIPP42127 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASIPP42127 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASIPP42127 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASIPP42127 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASIPP42127 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASIPP42127 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASIPP42127 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASIPP42127 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASIPP42127 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASIPP42127 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASIPP42127 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASIPP42127 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASIPP42127 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASIPP42127 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASIPP42127 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ASIPP42127 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASIPP42127 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASIPP42127 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASIPP42127 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASIPP42127 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASIPP42127 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ASIPP42127 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASIPP42127 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASIPP42127 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ASIPP42127 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASIPP42127 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASIPP42127 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASIPP42127 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASIPP42127 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASIPP42127 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASIPP42127 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms