Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPHP41219 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPHP41219 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPHP41219 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPHP41219 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPHP41219 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPHP41219 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPHP41219 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPHP41219 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPHP41219 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPHP41219 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPHP41219 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPHP41219 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPHP41219 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPHP41219 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPHP41219 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPHP41219 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPHP41219 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPHP41219 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPHP41219 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPHP41219 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPHP41219 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPHP41219 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPHP41219 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPHP41219 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPHP41219 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPHP41219 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPHP41219 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPHP41219 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRPHP41219 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRPHP41219 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRPHP41219 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPHP41219 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPHP41219 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPHP41219 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPHP41219 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPHP41219 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPHP41219 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPHP41219 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPHP41219 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPHP41219 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPHP41219 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPHP41219 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPHP41219 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPHP41219 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPHP41219 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPHP41219 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPHP41219 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPHP41219 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPHP41219 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPHP41219 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPHP41219 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPHP41219 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPHP41219 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPHP41219 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPHP41219 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPHP41219 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPHP41219 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPHP41219 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPHP41219 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPHP41219 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPHP41219 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPHP41219 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPHP41219 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPHP41219 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRPHP41219 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPHP41219 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPHP41219 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPHP41219 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPHP41219 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPHP41219 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPHP41219 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPHP41219 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPHP41219 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPHP41219 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPHP41219 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPHP41219 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPHP41219 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPHP41219 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPHP41219 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPHP41219 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPHP41219 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPHP41219 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPHP41219 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPHP41219 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPHP41219 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPHP41219 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPHP41219 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPHP41219 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPHP41219 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPHP41219 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPHP41219 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPHP41219 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPHP41219 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPHP41219 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPHP41219 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPHP41219 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPHP41219 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPHP41219 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPHP41219 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms