Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FDFT1P37268 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FDFT1P37268 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FDFT1P37268 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms