Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT20P35900 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT20P35900 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT20P35900 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT20P35900 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT20P35900 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT20P35900 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT20P35900 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT20P35900 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT20P35900 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT20P35900 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT20P35900 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT20P35900 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT20P35900 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT20P35900 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT20P35900 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT20P35900 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT20P35900 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT20P35900 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT20P35900 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT20P35900 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT20P35900 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT20P35900 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT20P35900 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT20P35900 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT20P35900 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT20P35900 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT20P35900 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT20P35900 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT20P35900 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT20P35900 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT20P35900 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT20P35900 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT20P35900 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT20P35900 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT20P35900 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT20P35900 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT20P35900 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT20P35900 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT20P35900 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT20P35900 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT20P35900 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT20P35900 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT20P35900 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT20P35900 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT20P35900 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT20P35900 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT20P35900 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT20P35900 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT20P35900 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT20P35900 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT20P35900 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT20P35900 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT20P35900 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT20P35900 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT20P35900 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT20P35900 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT20P35900 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT20P35900 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT20P35900 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT20P35900 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT20P35900 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT20P35900 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT20P35900 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT20P35900 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT20P35900 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT20P35900 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT20P35900 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT20P35900 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT20P35900 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT20P35900 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT20P35900 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT20P35900 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT20P35900 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT20P35900 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT20P35900 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT20P35900 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT20P35900 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT20P35900 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT20P35900 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT20P35900 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT20P35900 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT20P35900 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT20P35900 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT20P35900 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT20P35900 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT20P35900 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT20P35900 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT20P35900 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT20P35900 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT20P35900 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT20P35900 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT20P35900 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT20P35900 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT20P35900 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT20P35900 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT20P35900 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT20P35900 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT20P35900 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT20P35900 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms