Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD12P35452 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD12P35452 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms