Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF2P35227 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF2P35227 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms