Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNA3P32297 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA3P32297 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms