Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTX2P32243 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTX2P32243 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTX2P32243 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTX2P32243 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTX2P32243 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTX2P32243 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTX2P32243 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTX2P32243 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTX2P32243 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OTX2P32243 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTX2P32243 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTX2P32243 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTX2P32243 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTX2P32243 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTX2P32243 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTX2P32243 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTX2P32243 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTX2P32243 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTX2P32243 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OTX2P32243 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTX2P32243 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTX2P32243 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTX2P32243 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTX2P32243 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTX2P32243 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTX2P32243 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTX2P32243 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTX2P32243 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTX2P32243 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTX2P32243 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTX2P32243 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTX2P32243 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTX2P32243 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTX2P32243 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTX2P32243 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTX2P32243 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTX2P32243 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTX2P32243 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTX2P32243 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTX2P32243 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTX2P32243 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTX2P32243 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTX2P32243 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTX2P32243 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTX2P32243 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTX2P32243 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
OTX2P32243 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
OTX2P32243 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTX2P32243 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTX2P32243 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTX2P32243 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTX2P32243 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTX2P32243 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTX2P32243 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTX2P32243 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OTX2P32243 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTX2P32243 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTX2P32243 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTX2P32243 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTX2P32243 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTX2P32243 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTX2P32243 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTX2P32243 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTX2P32243 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTX2P32243 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTX2P32243 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTX2P32243 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTX2P32243 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OTX2P32243 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTX2P32243 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTX2P32243 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTX2P32243 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTX2P32243 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTX2P32243 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTX2P32243 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTX2P32243 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTX2P32243 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OTX2P32243 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTX2P32243 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTX2P32243 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTX2P32243 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTX2P32243 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTX2P32243 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTX2P32243 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTX2P32243 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTX2P32243 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTX2P32243 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTX2P32243 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTX2P32243 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTX2P32243 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTX2P32243 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OTX2P32243 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTX2P32243 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTX2P32243 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OTX2P32243 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTX2P32243 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTX2P32243 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTX2P32243 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTX2P32243 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms