Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MARCKSP29966 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARCKSP29966 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MARCKSP29966 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms