Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK6P29122 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK6P29122 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK6P29122 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK6P29122 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK6P29122 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK6P29122 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK6P29122 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK6P29122 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK6P29122 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms