Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBL1P28749 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBL1P28749 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBL1P28749 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBL1P28749 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBL1P28749 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBL1P28749 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBL1P28749 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBL1P28749 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBL1P28749 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RBL1P28749 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBL1P28749 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBL1P28749 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBL1P28749 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBL1P28749 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBL1P28749 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBL1P28749 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBL1P28749 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBL1P28749 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBL1P28749 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBL1P28749 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBL1P28749 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBL1P28749 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBL1P28749 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBL1P28749 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBL1P28749 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBL1P28749 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBL1P28749 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBL1P28749 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBL1P28749 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBL1P28749 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBL1P28749 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBL1P28749 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBL1P28749 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL1P28749 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL1P28749 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL1P28749 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL1P28749 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL1P28749 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL1P28749 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL1P28749 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL1P28749 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBL1P28749 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBL1P28749 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBL1P28749 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBL1P28749 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBL1P28749 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL1P28749 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL1P28749 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL1P28749 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBL1P28749 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBL1P28749 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBL1P28749 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBL1P28749 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBL1P28749 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBL1P28749 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBL1P28749 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBL1P28749 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBL1P28749 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBL1P28749 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBL1P28749 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBL1P28749 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBL1P28749 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL1P28749 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL1P28749 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL1P28749 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL1P28749 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL1P28749 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL1P28749 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL1P28749 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL1P28749 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL1P28749 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL1P28749 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL1P28749 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL1P28749 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL1P28749 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL1P28749 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL1P28749 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBL1P28749 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBL1P28749 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBL1P28749 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBL1P28749 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBL1P28749 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBL1P28749 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBL1P28749 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBL1P28749 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms