Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRB3P28472 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB3P28472 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRB3P28472 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms