Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMB4P28070 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMB4P28070 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB4P28070 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms