Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTAFRP25105 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTAFRP25105 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms