Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4BP23588 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4BP23588 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4BP23588 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4BP23588 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4BP23588 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4BP23588 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4BP23588 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
EIF4BP23588 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF4BP23588 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4BP23588 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4BP23588 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4BP23588 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4BP23588 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4BP23588 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EIF4BP23588 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4BP23588 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4BP23588 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF4BP23588 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4BP23588 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms