Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
HRCP23327 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
HRCP23327 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
HRCP23327 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
HRCP23327 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
HRCP23327 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
HRCP23327 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
HRCP23327 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
HRCP23327 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
HRCP23327 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
HRCP23327 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
HRCP23327 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
HRCP23327 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
HRCP23327 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
HRCP23327 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
HRCP23327 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
HRCP23327 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
HRCP23327 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
HRCP23327 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
HRCP23327 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
HRCP23327 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
HRCP23327 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
HRCP23327 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
HRCP23327 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
HRCP23327 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
HRCP23327 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
HRCP23327 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HRCP23327 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HRCP23327 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HRCP23327 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
HRCP23327 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
HRCP23327 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HRCP23327 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HRCP23327 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
HRCP23327 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
HRCP23327 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
HRCP23327 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
HRCP23327 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
HRCP23327 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
HRCP23327 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
HRCP23327 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
HRCP23327 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HRCP23327 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
HRCP23327 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HRCP23327 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
HRCP23327 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HRCP23327 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
HRCP23327 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
HRCP23327 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
HRCP23327 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
HRCP23327 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
HRCP23327 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
HRCP23327 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
HRCP23327 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
HRCP23327 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
HRCP23327 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
HRCP23327 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
HRCP23327 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
HRCP23327 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
HRCP23327 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.44■■■■□ 3.74
HRCP23327 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
HRCP23327 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
HRCP23327 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
HRCP23327 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
HRCP23327 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
HRCP23327 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
HRCP23327 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
HRCP23327 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
HRCP23327 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
HRCP23327 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HRCP23327 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
HRCP23327 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
HRCP23327 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
HRCP23327 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
HRCP23327 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
HRCP23327 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
HRCP23327 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
HRCP23327 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
HRCP23327 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
HRCP23327 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
HRCP23327 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
HRCP23327 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
HRCP23327 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
HRCP23327 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
HRCP23327 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
HRCP23327 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
HRCP23327 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
HRCP23327 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
HRCP23327 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
HRCP23327 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
HRCP23327 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
HRCP23327 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
HRCP23327 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
HRCP23327 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
HRCP23327 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HRCP23327 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HRCP23327 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
HRCP23327 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HRCP23327 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
HRCP23327 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms