Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBA1P22314 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBA1P22314 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBA1P22314 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBA1P22314 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBA1P22314 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBA1P22314 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBA1P22314 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBA1P22314 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBA1P22314 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBA1P22314 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
UBA1P22314 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBA1P22314 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBA1P22314 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBA1P22314 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBA1P22314 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBA1P22314 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBA1P22314 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBA1P22314 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBA1P22314 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBA1P22314 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
UBA1P22314 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBA1P22314 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBA1P22314 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBA1P22314 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBA1P22314 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBA1P22314 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UBA1P22314 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA1P22314 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA1P22314 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA1P22314 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA1P22314 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA1P22314 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA1P22314 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA1P22314 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBA1P22314 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
UBA1P22314 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBA1P22314 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBA1P22314 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBA1P22314 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBA1P22314 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBA1P22314 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBA1P22314 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBA1P22314 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBA1P22314 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
UBA1P22314 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
UBA1P22314 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBA1P22314 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBA1P22314 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UBA1P22314 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBA1P22314 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA1P22314 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA1P22314 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA1P22314 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA1P22314 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA1P22314 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA1P22314 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA1P22314 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBA1P22314 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBA1P22314 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBA1P22314 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBA1P22314 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBA1P22314 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UBA1P22314 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UBA1P22314 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBA1P22314 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UBA1P22314 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBA1P22314 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBA1P22314 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBA1P22314 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBA1P22314 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBA1P22314 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBA1P22314 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBA1P22314 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBA1P22314 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBA1P22314 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBA1P22314 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBA1P22314 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBA1P22314 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBA1P22314 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBA1P22314 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBA1P22314 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBA1P22314 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBA1P22314 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBA1P22314 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBA1P22314 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBA1P22314 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBA1P22314 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBA1P22314 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
UBA1P22314 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBA1P22314 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBA1P22314 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBA1P22314 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBA1P22314 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBA1P22314 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBA1P22314 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBA1P22314 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
UBA1P22314 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBA1P22314 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBA1P22314 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms