Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN3P20807 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN3P20807 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN3P20807 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms