Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LBPP18428 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBPP18428 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBPP18428 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LBPP18428 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LBPP18428 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LBPP18428 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBPP18428 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBPP18428 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBPP18428 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBPP18428 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBPP18428 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBPP18428 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBPP18428 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBPP18428 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBPP18428 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LBPP18428 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBPP18428 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBPP18428 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBPP18428 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBPP18428 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBPP18428 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LBPP18428 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LBPP18428 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LBPP18428 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LBPP18428 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LBPP18428 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBPP18428 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBPP18428 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBPP18428 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBPP18428 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LBPP18428 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBPP18428 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LBPP18428 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBPP18428 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBPP18428 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LBPP18428 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LBPP18428 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LBPP18428 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LBPP18428 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBPP18428 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBPP18428 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBPP18428 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBPP18428 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBPP18428 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LBPP18428 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LBPP18428 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBPP18428 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBPP18428 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LBPP18428 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LBPP18428 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBPP18428 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBPP18428 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBPP18428 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBPP18428 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LBPP18428 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBPP18428 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBPP18428 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBPP18428 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBPP18428 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBPP18428 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBPP18428 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBPP18428 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBPP18428 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBPP18428 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBPP18428 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBPP18428 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LBPP18428 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LBPP18428 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LBPP18428 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LBPP18428 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LBPP18428 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LBPP18428 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LBPP18428 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LBPP18428 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LBPP18428 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LBPP18428 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LBPP18428 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LBPP18428 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LBPP18428 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LBPP18428 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LBPP18428 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LBPP18428 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LBPP18428 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LBPP18428 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LBPP18428 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LBPP18428 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LBPP18428 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LBPP18428 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LBPP18428 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LBPP18428 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LBPP18428 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LBPP18428 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LBPP18428 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LBPP18428 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LBPP18428 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LBPP18428 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LBPP18428 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LBPP18428 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LBPP18428 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms