Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMPD1P17405 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMPD1P17405 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMPD1P17405 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms