Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCK1P16333 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCK1P16333 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCK1P16333 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCK1P16333 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCK1P16333 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCK1P16333 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK1P16333 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK1P16333 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK1P16333 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK1P16333 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK1P16333 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK1P16333 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK1P16333 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK1P16333 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK1P16333 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK1P16333 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK1P16333 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK1P16333 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK1P16333 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK1P16333 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK1P16333 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCK1P16333 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCK1P16333 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK1P16333 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK1P16333 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK1P16333 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK1P16333 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK1P16333 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK1P16333 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK1P16333 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK1P16333 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK1P16333 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK1P16333 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK1P16333 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK1P16333 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK1P16333 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK1P16333 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK1P16333 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK1P16333 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK1P16333 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK1P16333 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK1P16333 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK1P16333 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK1P16333 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK1P16333 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK1P16333 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK1P16333 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK1P16333 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCK1P16333 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCK1P16333 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCK1P16333 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCK1P16333 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCK1P16333 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCK1P16333 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCK1P16333 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCK1P16333 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCK1P16333 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCK1P16333 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCK1P16333 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCK1P16333 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCK1P16333 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCK1P16333 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCK1P16333 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCK1P16333 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCK1P16333 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCK1P16333 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCK1P16333 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCK1P16333 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NCK1P16333 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCK1P16333 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCK1P16333 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCK1P16333 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCK1P16333 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCK1P16333 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCK1P16333 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCK1P16333 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCK1P16333 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCK1P16333 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCK1P16333 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCK1P16333 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCK1P16333 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCK1P16333 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCK1P16333 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCK1P16333 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCK1P16333 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCK1P16333 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCK1P16333 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCK1P16333 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCK1P16333 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCK1P16333 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCK1P16333 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCK1P16333 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCK1P16333 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCK1P16333 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCK1P16333 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCK1P16333 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCK1P16333 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NCK1P16333 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCK1P16333 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms