Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV1P15498 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV1P15498 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV1P15498 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV1P15498 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV1P15498 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV1P15498 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV1P15498 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAV1P15498 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAV1P15498 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAV1P15498 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAV1P15498 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAV1P15498 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAV1P15498 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAV1P15498 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAV1P15498 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAV1P15498 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAV1P15498 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAV1P15498 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAV1P15498 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAV1P15498 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAV1P15498 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAV1P15498 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAV1P15498 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAV1P15498 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAV1P15498 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAV1P15498 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAV1P15498 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VAV1P15498 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAV1P15498 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAV1P15498 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAV1P15498 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV1P15498 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV1P15498 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV1P15498 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV1P15498 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV1P15498 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV1P15498 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV1P15498 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV1P15498 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV1P15498 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV1P15498 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV1P15498 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV1P15498 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV1P15498 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV1P15498 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAV1P15498 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAV1P15498 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAV1P15498 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAV1P15498 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAV1P15498 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV1P15498 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV1P15498 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV1P15498 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV1P15498 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV1P15498 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV1P15498 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV1P15498 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV1P15498 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV1P15498 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV1P15498 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV1P15498 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV1P15498 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV1P15498 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV1P15498 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV1P15498 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV1P15498 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAV1P15498 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAV1P15498 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAV1P15498 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV1P15498 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV1P15498 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV1P15498 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAV1P15498 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAV1P15498 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAV1P15498 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAV1P15498 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAV1P15498 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAV1P15498 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAV1P15498 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAV1P15498 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAV1P15498 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAV1P15498 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAV1P15498 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAV1P15498 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAV1P15498 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV1P15498 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV1P15498 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV1P15498 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV1P15498 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV1P15498 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV1P15498 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV1P15498 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV1P15498 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV1P15498 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV1P15498 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV1P15498 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV1P15498 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV1P15498 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV1P15498 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms