Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ETFAP13804 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ETFAP13804 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ETFAP13804 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ETFAP13804 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ETFAP13804 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ETFAP13804 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ETFAP13804 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ETFAP13804 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ETFAP13804 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ETFAP13804 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ETFAP13804 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ETFAP13804 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ETFAP13804 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ETFAP13804 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETFAP13804 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETFAP13804 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETFAP13804 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETFAP13804 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ETFAP13804 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ETFAP13804 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ETFAP13804 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ETFAP13804 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ETFAP13804 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ETFAP13804 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ETFAP13804 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFAP13804 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFAP13804 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFAP13804 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFAP13804 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFAP13804 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETFAP13804 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETFAP13804 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETFAP13804 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETFAP13804 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETFAP13804 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETFAP13804 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETFAP13804 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETFAP13804 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETFAP13804 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETFAP13804 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFAP13804 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFAP13804 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFAP13804 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFAP13804 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFAP13804 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFAP13804 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFAP13804 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFAP13804 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFAP13804 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFAP13804 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFAP13804 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFAP13804 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFAP13804 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFAP13804 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFAP13804 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFAP13804 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFAP13804 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFAP13804 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFAP13804 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFAP13804 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFAP13804 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFAP13804 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ETFAP13804 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETFAP13804 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETFAP13804 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETFAP13804 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETFAP13804 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ETFAP13804 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETFAP13804 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFAP13804 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETFAP13804 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETFAP13804 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETFAP13804 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETFAP13804 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFAP13804 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFAP13804 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFAP13804 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFAP13804 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFAP13804 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFAP13804 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFAP13804 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFAP13804 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFAP13804 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFAP13804 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFAP13804 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFAP13804 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ETFAP13804 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETFAP13804 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETFAP13804 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFAP13804 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFAP13804 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFAP13804 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFAP13804 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFAP13804 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFAP13804 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFAP13804 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFAP13804 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFAP13804 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFAP13804 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms