Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM1P13164 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IFITM1P13164 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms