Protein–RNA interactions for Protein: P10644

PRKAR1A, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1AP10644 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR1AP10644 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1AP10644 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAR1AP10644 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.3 ms