Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TGFB3P10600 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TGFB3P10600 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TGFB3P10600 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms