Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRFP10586 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRFP10586 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms