Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
IGHV1-8P0DP01 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IGHV1-8P0DP01 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGHV1-8P0DP01 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms