Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD2P0DJD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
RGPD2P0DJD1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RGPD2P0DJD1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RGPD2P0DJD1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGPD2P0DJD1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms